Program yang dijalankan oleh Yayasan BUMI tahun 2016-2019 adalah:
- Pendidikan Pembangunan Berkelanjutan
- Pengembangan Skema Pengaduan Publik untuk Kasus Sumber Daya Alam
- Advokasi One Data Pembangunan
- Advokasi Kebijakan Kelola Kekayaan Alam
- Dukungan bagi Implementasi Mitigasi dan Adaptasi Perubahan Iklim
- Pengembangan Sistem Informasi dan Aplikasi terkait Lingkungan Hidup dan Kekayaan Alam